乌黑的夜晚，一位特务寂静潜入日本警方某机构，盗走了记录着列国情报机构主要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方以及FBI捕快赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与特务睁开追赶。最初，流亡者的车辆坠落绝壁。次日，柯南（平地南 配音）以及同伴们离开东都水族馆不雅光，成果发明一位受伤的斑斓男子（天海佑希 配音）。该男子处于掉忆状况，身上的手机也破坏没法利用。柯南等人承诺要帮她规复影象，当他们人多口杂之际，藏正在暗处的黑衣构造成员贝尔摩德（小山茉美 配音）冷冷地谛视着这统统。正在相处进程中，男子不凡的技艺以及奇异的言谈举止让灰原哀（林原惠美 配音）对于其实在身份发生思疑。　　方才还一派平和的水族馆，沉溺正在欢愉当中的人们，底子会想到跟着那名奥秘男子身手的规复，本身顿时就要被卷入暗中构造的殛毙以及紊乱当中……